温州港引航站是根据温政办[2011]180号《温州市人民政府办公室关于印发温州市港航管理局主要职责内设机构和人员编制规定的通知》精神，于2012年6月设立的公益一类正科级财政全额拨款事业单位，行政隶属温州市港航管理中心，委托温州港集团管理。

　　温州港引航站是唯一一家在温州港水域实施船舶引航的引航机构，主要负责对外国籍船舶以及有关机关批准发布或法律、行政法规规定应当申请引航的中国籍船舶实施引航；对有需要申请引航的其他船舶提供引航服务。

　　温州港引航站前身是温州市港务管理局（现温州市港航管理中心）下属部门温州港监的内设科室——引航科。1996年1月从温州港监分离出来，成立温州市港务管理局下属的一个职能部门——温州港引航站；2004年体制改革，温州市港务管理局同温州市航管处合并成立温州市港航管理局时，改名为温州港引航中心；2011年港航体制改革时，温州港引航站正式设立为独立法人资格的事业单位，归属温州市港航管理局；2019年体制改革时，上级行政主管单位改名为温州市港航管理中心。

　　单位事业编制数19人，现有事业人员16人，其中引航员10人（高级引航员5人，一级引航员4人，助理（见习）引航员1人）。内设三个科室：引航科、安全卫环科、综合科。